У системі позашкільної освіти міста Конотоп станція юних натуралістів–єдиний профільний еколого-натуралістичний навчальний заклад, який цілеспрямовано займається екологічною освітою та вихованням учнівської молоді, залученням школярів до пошуково–дослідницької та природоохоронної роботи, організацією змістовного дозвілля дітей відповідно до їх інтересів та запитів.
Розташований на околиці міста мальовничий куточок вабить себе до дітей і дорослих, адже, де ще можна віднайти казкове розмаїття квітів та отримати незабутнє враження від спілкування з декоративними і домашніми тваринами.
Конотопської СЮН має давню історію існування, яка бере початок з 1949 року. За ініціативи колективу школи № 2 в районі «Кандибиної греблі» була виділена земельна ділянка площею 13 га, на якій було розбито і посаджено фруктовий сад, створено пасіку, відкрито метеостанцію, організовано невеликий звіринець та розпочато діяльність перших гуртків екологічного спрямування: юних садоводів, агрономів, пасічників.
Керівником навчального закладу був призначений директор середньої школи №2 Крамар В. Я., і який став ініціатором юннатівського руху на Конотопщині.
У такому вигляді станція юних натуралістів існувала до 60-х років, припинивши свою діяльність у зв'язку з будівництвом в районі «Кандибиної греблі» приміщення інтернату №2. Відродження навчального закладу відбулося у 1987 році в колишньому приміщенні ЗОШ №13, а на посаді директора Конотопської СЮН працювали Матвійчук М.М. (1987-1995), Гаряча В.І. (1995-2003).
З серпня 2003 року заклад здійснював свою діяльність в приміщенні ДНЗ №10 «Ялинка» під керівництвом директора Демехи І.В. (2003 – 2004 рр.).
Згідно з рішенням Конотопської міської ради від 01.07.03 р. № 235 Конотопська станція юних натуралістів отримує нове приміщення – історичну пам'ятку – маєток генерала М.І.Драгомирова, в якому після проведення капітального ремонту влітку 2007 року продовжує свою діяльність по сьогоднішній час. З 2004 року освітню установу очолює директор Отченашенко Вікторія Миколаївна.